自2023年10月1日起，日本站賣家的合規發票上需要有日本消費稅注冊號。根據日本國稅廳的要求，已申請JCT稅號的企業需要在首個JCT生效財年結束后的前兩個月提交首次申報。比如說，賣家是在2023年1月1日-12月31日這個時間段下的號，就需要在次年，也就是今年的3月前完成第一次申報。
JCT申報周期
日本JCT的申報首次為年報，申報1次。申報截止時間為納稅期截止之日起2個月內提交（也就是2月28日）。此后會根據企業前一年的納稅額，稅局可能會要求按月/季度/半年的頻次預繳稅金，賣家可以主動根據前一年的納稅總額主動向稅局提起消費稅申報頻次變更申請。
日本JCT申報流程
1、準備必要文件
在提交申報前，需要準備一系列必要的文件，例如發票、裝箱單、運輸文件等。這些文件通常需要翻譯成日文，以確保日本海關能夠理解并處理申報。
2、選擇正確的海關流程
根據商品性質和進口或出口的具體情況，選擇合適的海關流程。這可能涉及到一般進口、特殊監管區域、設施區等不同的流程。
3、申報流程
代理機構會幫助企業填寫申報表等相關信息，提交給日本海關；確保所有信息的準確性非常重要的。
4、征收關稅
根據商品的分類和價值，可能需要征收相應的關稅。代理機構需要了解關稅稅率，并確保在申報過程中正確計算和征收關稅。
5、申報完成后日本海關申報進行審核
機構需要配合并確保申報的合規性。如有需要，可能需要提供額外的文件或信息。
6、物流處理
順利通過報關后，商品可以順利進出日本。代理機構需要確保與物流公司的協調，以保證商品的順利運輸。
申報方式與繳納稅金
日本JCT申報分為簡易申報和標準申報，基準年內銷售額在5000萬日元（含5000萬）以下的企業選擇簡易申報即可。
簡易申報稅金=凈銷售額*10%- 基礎稅金*核對成本率（零售業為80%）;
標準申報稅金=銷售產生的JCT-清關時繳納的JCT-亞馬遜相關費用中的JCT（亞馬遜相關費用包括但不限于運輸費和倉儲費）;
例如一個企業基準年內銷售額為1000萬元，稅金為100萬日元，假設企業有效的進項單據有限，進項稅加總后抵扣稅金金額為50萬日元，那么企業按照標準憑票抵扣方式申報的稅金是50萬日元，按照簡易申報的稅金是20萬日元。
需要注意的是，根據日本國稅廳“令和6年度稅制修改大綱”，從2024年10月1日起，日本境內的跨境企業賣家，將不再適用JCT簡易申報模式。
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